Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CtcflA2APF3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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