Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930469K13RikA0A286YDB2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms