Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
6430628N08RikA0A0U1RQ45 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.08■□□□□ 0
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.07■□□□□ 0
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms