Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms