Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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