Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms