Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRT9

Gm28490, Predicted gene 28490, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28490A0A087WRT9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm28490A0A087WRT9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm28490A0A087WRT9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm28490A0A087WRT9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm28490A0A087WRT9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm28490A0A087WRT9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm28490A0A087WRT9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm28490A0A087WRT9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm28490A0A087WRT9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm28490A0A087WRT9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm28490A0A087WRT9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm28490A0A087WRT9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm28490A0A087WRT9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm28490A0A087WRT9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28490A0A087WRT9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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