Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 DIRC3-AS1-201ENST00000452813 557 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007991.4-201ENST00000522970 605 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC100832.2-201ENST00000582080 776 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 CT45A3-202ENST00000598716 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 ABI1-206ENST00000376140 1446 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL47-201ENST00000259038 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 MALAT1-203ENST00000544868 480 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC125-201ENST00000383374 2006 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
TRAPPC6BQ86SZ2 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC6BQ86SZ2 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAPPC6BQ86SZ2 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms