Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Mir6372-201ENSMUST00000185114 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm45636-201ENSMUST00000210497 1064 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm24165-201ENSMUST00000082718 128 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm24579-201ENSMUST00000103964 144 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Olfr196-202ENSMUST00000205471 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm17154-201ENSMUST00000165748 431 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm45438-201ENSMUST00000210242 564 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm8251-201ENSMUST00000168641 5985 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm10477-201ENSMUST00000101552 165 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm26002-201ENSMUST00000101915 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm12636-201ENSMUST00000117395 624 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm13577-201ENSMUST00000121365 205 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Zfp950-205ENSMUST00000148569 192 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm17119-201ENSMUST00000163943 280 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm14007-201ENSMUST00000118288 210 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm16349-201ENSMUST00000149990 394 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Col5a3Q9JLI2 Gm28986-201ENSMUST00000189682 678 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
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