Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm12044-201ENSMUST00000120335 213 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm14951-201ENSMUST00000143622 570 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm44458-201ENSMUST00000196594 143 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm15659-201ENSMUST00000118881 341 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm24948-201ENSMUST00000082866 207 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm10477-201ENSMUST00000101552 165 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm24264-201ENSMUST00000179835 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm25404-201ENSMUST00000082970 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtpruB1AUH1 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms