Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm27733-201ENSMUST00000184803 68 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm10042-201ENSMUST00000079884 78 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Olfr695-201ENSMUST00000216868 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Olfr215-201ENSMUST00000061723 4112 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Olfr609-203ENSMUST00000216360 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Zfp616-201ENSMUST00000074813 5014 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm12858-201ENSMUST00000121913 208 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm24505-201ENSMUST00000157682 126 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm37698-201ENSMUST00000192605 463 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Olfm3-201ENSMUST00000051309 3928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Olfr1535-202ENSMUST00000217519 3959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm22497-201ENSMUST00000104499 131 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm23856-201ENSMUST00000158380 99 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm28924-201ENSMUST00000190012 241 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm281-201ENSMUST00000144914 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm24998-201ENSMUST00000157908 89 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm23306-201ENSMUST00000179058 105 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm27450-201ENSMUST00000104632 90 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxd11P23813 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms