Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm15309-201ENSMUST00000121644 240 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm25624-201ENSMUST00000157222 275 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm12814-201ENSMUST00000117091 846 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm21827-201ENSMUST00000178247 423 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Zfp950-205ENSMUST00000148569 192 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cpne9Q1RLL3 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms