Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 AC012640.3-201ENST00000607847 430 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 MED24-234ENST00000614384 454 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 RN7SL820P-201ENST00000616437 299 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 AC073857.1-201ENST00000625082 1054 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 TBC1D19-205ENST00000511789 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 ALOX5AP-201ENST00000380490 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 AC015987.1-201ENST00000419211 804 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 AC105393.2-201ENST00000431911 549 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 RPL7P14-201ENST00000449851 741 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 SSU72P6-201ENST00000532644 488 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 PCED1B-AS1-207ENST00000551432 522 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 RN7SL25P-201ENST00000583862 260 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 Z99289.1-201ENST00000585373 807 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 AC114488.2-208ENST00000591592 578 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 ZNF85-206ENST00000596476 1259 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 CARSP1-201ENST00000603171 889 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
IFFO1Q0D2I5 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AL359475.1-201ENST00000414505 292 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 NRIR-202ENST00000414795 506 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC118470.1-201ENST00000419891 453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC110995.1-202ENST00000422914 860 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AL357314.1-201ENST00000433521 806 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 ANXA2P2-201ENST00000435128 1020 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC013727.1-202ENST00000455716 580 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 RN7SL647P-201ENST00000485429 300 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC079089.1-203ENST00000533300 431 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC138123.2-204ENST00000547432 721 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC092720.1-203ENST00000563921 550 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 MIR3689C-201ENST00000581239 72 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC105243.1-202ENST00000583942 847 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 RN7SL664P-201ENST00000584239 305 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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