Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfkbiaQ9Z1E3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NfkbiaQ9Z1E3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms