Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cog1Q9Z160 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog1Q9Z160 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms