Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Skp2Q9Z0Z3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms