Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb6Q9Z0T9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms