Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms