Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PplQ9R269 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PplQ9R269 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PplQ9R269 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PplQ9R269 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PplQ9R269 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PplQ9R269 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms