Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtsjQ9R014 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms