Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms