Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp21Q9QZL6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms