Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vps29Q9QZ88 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps29Q9QZ88 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps29Q9QZ88 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps29Q9QZ88 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vps29Q9QZ88 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms