Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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