Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms