Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VapbQ9QY76 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms