Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pdzd4Q9QY39 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms