Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Pcsk1nQ9QXV0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms