Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk1eQ9JMK2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms