Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms