Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tlr5Q9JLF7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms