Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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