Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk3aQ9JKX8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms