Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl39Q9JKF7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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