Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nectin1Q9JKF6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms