Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ap4m1Q9JKC7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ap4m1Q9JKC7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ap4m1Q9JKC7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms