Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc12a4Q9JIS8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms