Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copb1Q9JIF7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Copb1Q9JIF7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms