Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Tmod3Q9JHJ0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Tmod3Q9JHJ0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Tmod3Q9JHJ0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Tmod3Q9JHJ0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Tmod3Q9JHJ0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmod3Q9JHJ0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Tmod3Q9JHJ0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmod3Q9JHJ0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Tmod3Q9JHJ0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Tmod3Q9JHJ0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmod3Q9JHJ0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Tmod3Q9JHJ0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Tmod3Q9JHJ0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Tmod3Q9JHJ0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod3Q9JHJ0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod3Q9JHJ0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod3Q9JHJ0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod3Q9JHJ0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod3Q9JHJ0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod3Q9JHJ0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod3Q9JHJ0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod3Q9JHJ0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod3Q9JHJ0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod3Q9JHJ0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod3Q9JHJ0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod3Q9JHJ0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod3Q9JHJ0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod3Q9JHJ0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmod3Q9JHJ0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod3Q9JHJ0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod3Q9JHJ0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod3Q9JHJ0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod3Q9JHJ0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod3Q9JHJ0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmod3Q9JHJ0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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