Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rapgef4Q9EQZ6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms