Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rhox9Q9EQM5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rhox9Q9EQM5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox9Q9EQM5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Rhox9Q9EQM5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rhox9Q9EQM5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rhox9Q9EQM5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rhox9Q9EQM5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox9Q9EQM5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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