Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Ndst3Q9EQH7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Ndst3Q9EQH7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Ndst3Q9EQH7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Ndst3Q9EQH7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Ndst3Q9EQH7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Ndst3Q9EQH7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndst3Q9EQH7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Ndst3Q9EQH7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Ndst3Q9EQH7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Ndst3Q9EQH7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Ndst3Q9EQH7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ndst3Q9EQH7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ndst3Q9EQH7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ndst3Q9EQH7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ndst3Q9EQH7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ndst3Q9EQH7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndst3Q9EQH7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndst3Q9EQH7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndst3Q9EQH7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndst3Q9EQH7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndst3Q9EQH7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndst3Q9EQH7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndst3Q9EQH7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndst3Q9EQH7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndst3Q9EQH7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndst3Q9EQH7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndst3Q9EQH7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms