Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr1Q9EPQ1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr1Q9EPQ1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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