Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL6

Mmp1b, Interstitial collagenase B, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1bQ9EPL6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp1bQ9EPL6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mmp1bQ9EPL6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms