Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r53Q9EP93 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms