Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap3s1Q9DCR2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms