Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3fQ9DCH4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3fQ9DCH4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms