Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xab2Q9DCD2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Xab2Q9DCD2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xab2Q9DCD2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xab2Q9DCD2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xab2Q9DCD2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xab2Q9DCD2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xab2Q9DCD2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Xab2Q9DCD2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xab2Q9DCD2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xab2Q9DCD2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xab2Q9DCD2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xab2Q9DCD2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms