Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp27a1Q9DBG1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp27a1Q9DBG1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp27a1Q9DBG1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp27a1Q9DBG1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp27a1Q9DBG1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp27a1Q9DBG1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp27a1Q9DBG1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp27a1Q9DBG1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp27a1Q9DBG1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp27a1Q9DBG1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp27a1Q9DBG1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp27a1Q9DBG1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp27a1Q9DBG1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp27a1Q9DBG1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp27a1Q9DBG1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp27a1Q9DBG1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp27a1Q9DBG1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp27a1Q9DBG1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp27a1Q9DBG1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp27a1Q9DBG1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp27a1Q9DBG1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp27a1Q9DBG1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp27a1Q9DBG1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp27a1Q9DBG1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cyp27a1Q9DBG1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cyp27a1Q9DBG1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cyp27a1Q9DBG1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp27a1Q9DBG1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms