Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Smg9Q9DB90 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Smg9Q9DB90 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Smg9Q9DB90 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Smg9Q9DB90 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smg9Q9DB90 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Smg9Q9DB90 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Smg9Q9DB90 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Smg9Q9DB90 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg9Q9DB90 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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